Nowy zestaw do wykrywania kwasu nukleinowego w koronawirusie (SARS-Cov-2).
New Coronavirus(SARS-Cov-2) Nucleic Acid Detection Kit
(Flurudascent RT-PCR Probe Method) Product Manual
【Pproduktt name 】Zestaw do wykrywania kwasu nukleinowego nowego wirusa koronowego (SARS-Cov-2) (metoda fluorescencyjnej sondy RT-PCR)
【Packaging specjeślications 】25 testów/zestaw
【Intended uswiek】
Zestaw ten służy do jakościowego wykrywania kwasu nukleinowego nowego koronaawirusa w wymazach z nosogardzieli, wymazach z jamy ustnej i gardła, wymazach z przedniego nosa, wymazach ze środkowej części małżowiny nosowej, popłuczynach nosa i aspiratach z nosa pobranych od osób podejrzanych o zakażenie Covid19 przez lekarza. Wykrycie genów ORF1ab i N nowego koronaawirusa może zostać wykorzystane do diagnostyki pomocniczej i monitorowania epidemiologicznego infekcji nowym koronawirusem.
【Principles of the procedure 】
Zestaw ten jest przeznaczony dla specyficznych sond TaqMan i specyficznych starterów zaprojektowanych dla sekwencji genów ORF1ab i N nowego wirusa koronowego (SARS-Cov-2). Roztwór do reakcji PCR zawiera 3 zestawy specyficznych starterów i sond fluorescencyjnych do specyficznego wykrywania obiektów docelowych, a dodatkowy zestaw specyficznych starterów i sond fluorescencyjnych służy jako wewnętrzna kontrola standardowa zestawu do wykrywania endogennych genów metabolizmu podstawowego.
Zasada testu polega na tym, że specyficzna sonda fluorescencyjna jest trawiona i rozkładana przez aktywność egzonukleazy enzymu Taq w reakcji PCR, w wyniku czego reporterowa grupa fluorescencyjna i wygaszona grupa fluorescencyjna zostają oddzielone, dzięki czemu system monitorowania fluorescencji może otrzymać sygnał fluorescencyjny sygnał, a następnie poprzez efekt wzbogacenia amplifikacji PCR, sygnał fluorescencji sondy osiąga ustaloną wartość progową-wartość Ct (próg cyklu). W przypadku braku docelowego amplikonu, grupa reporterowa sondy znajduje się blisko grupy wygaszającej. W tym momencie następuje transfer energii rezonansu fluorescencji, a fluorescencja grupy reporterowej jest wygaszana przez grupę wygaszającą, tak że sygnał fluorescencyjny nie może zostać wykryty przez fluorescencyjny instrument PCR.
W celu monitorowania użycia odczynników w trakcie testu zestaw wyposażony jest w kontrolę pozytywną i negatywną: kontrola pozytywna zawiera rekombinowany plazmid w miejscu docelowym, a kontrola negatywna to woda destylowana, która służy do monitorowania zanieczyszczenia środowiska. Zaleca się jednoczesne ustawienie kontroli dodatniej i ujemnej podczas badania.
【Main componets 】
Cat. No. | BST-SARS-25 | BST-SARS-DR-25 | Składent | |
Name | Specifikacja | Ilośćto | Ilośćto | |
Pozytywna kontrola | 180 µl/fiolkę | 1 | 1 | Sztucznie skonstruowane plazmidy, Woda destylowana |
Kontrola negatywna | 180 µl/fiolkę | 1 | 1 | Woda destylowana |
Mieszanka SARS-Cov-2 | 358,5 µl/fiolkę | 1 | / | Specyficzne pary starterów, specyficzne sondy fluorescencyjne do wykrywania, dNTP, MgCl2, KCl, Tris-Hcl, woda destylowana itp. |
Mieszanka enzymów | 16,5 µl/fiolkę | 1 | / | Enzymy Taq, odwrotna transkryptaza, enzymy UNG itp. |
Mieszanka SARS-Cov-2 (liofilizowana) | 25 testów/fiolkę | / | 1 | Specyficzne pary starterów, specyficzne sondy fluorescencyjne do wykrywania, dNTP, enzymy Taq, odwrotna transkryptaza, woda destylowana itp. |
2x bufor | 375 µl/fiolkę | / | 1 | MgCl2, KCl, Tris-Hcl, woda destylowana itp. |
Notatka:(1) Nie można mieszać ani zamieniać składników różnych zestawów seryjnych.
(2) Przygotuj własny odczynnik: Zestaw do ekstrakcji kwasu nukleinowego.
【Storage condtoons I expiration date 】
For BST-SARS-25:Transportuj i przechowuj przez długi czas w temperaturze -20±5℃.
For BST-SARS-DR-25:Transport w temperaturze pokojowej. Przechowywać przez dłuższy czas w temperaturze -20±5℃.
Unikaj powtarzających się cykli zamrażania i rozmrażania. Okres ważności został wstępnie ustalony na 12 miesięcy.
Na etykiecie znajduje się data produkcji i użytkowania.
Po pierwszym otwarciu odczynnik można przechowywać w temperaturze -20±5°C nie dłużej niż 1 miesiąc lub do końca okresu ważności odczynnika, w zależności od tego, która data przypada wcześniej, aby uniknąć powtarzających się cykli zamrażania i rozmrażania oraz liczby zamrożeń odczynnika -cykle rozmrażania nie powinny przekraczać 6 razy.
【Applicable instrument】ABI 7500, SLAN-96P, Roche-LightCycler-480.
【Sample requirements 】
1. Odpowiedni typ próbki: roztwór ekstrahowanego kwasu nukleinowego.
2. Przechowywanie i transport próbek: Przechowywać w temperaturze -20±5°C przez 6 miesięcy. Zamrażać i rozmrażać próbki nie więcej niż 6 razy.
【Tzałing mettaczki】
1.Nucleic acid extraction
Wybierz odpowiedni zestaw do ekstrakcji kwasu nukleinowego w celu ekstrakcji wirusowego kwasu nukleinowego i postępuj zgodnie z instrukcjami odpowiedniego zestawu. Zaleca się stosowanie zestawu do ekstrakcji i oczyszczania kwasów nukleinowych wyprodukowanego przez Yixin Bio-Tech (Guangzhou) Co., Ltd. lub równoważnego zestawu do oczyszczania kwasów nukleinowych.
2. Rkażdytion wieknt preparation
2.1 For BST-SARS-25:
( 1) Usuń mieszankę SARS-Cov-2 i mieszaninę enzymów, całkowicie rozpuść w temperaturze pokojowej, dokładnie wymieszaj za pomocą urządzenia Vortex, a następnie krótko odwiruj.
(2) 16,5 µl mieszanki enzymatycznej dodano do 358,5 µl mieszanki SARS-Cov-2 i dokładnie wymieszano, aby otrzymać zmieszany roztwór reakcyjny.
(3) Przygotuj czystą probówkę ósemkową do PCR o pojemności 0,2 mL i oznacz ją 15 µl powyższego zmieszanego roztworu reakcyjnego na studzienkę.
(4) Dodać 15 µl oczyszczonego roztworu kwasu nukleinowego, kontrolę dodatnią i kontrolę ujemną i ostrożnie zamknąć ósemkową zakrętkę probówki.
(5) Dobrze wymieszaj, odwracając probówkę do góry nogami i szybko odwiruj, aby zagęścić płyn na dnie probówki.
1
2.2 For BST-SARS-DR-25:
( 1) Dodaj 375 ul 2x buforu do mieszanki SARS-Cov-2 ((liofilizowanej), aby przygotować mieszaninę reakcyjną. Dokładnie wymieszaj przez pipetowanie, a następnie krótko odwiruj. (Po przygotowaniu mieszaniny reakcyjnej zaleca się przechowywanie w temperaturze -20℃ w temperaturze długotrwałe przechowywanie.)
(2) Przygotuj czystą probówkę ósemkową do PCR o pojemności 0,2 mL i oznacz ją 15 µl mieszaniny reakcyjnej na dołek.
(3) Dodać 15 μl oczyszczonego roztworu kwasu nukleinowego, kontrolę dodatnią i kontrolę ujemną i ostrożnie zakręcić probówkę ósemkową.
(4) Dobrze wymieszaj, odwracając probówkę do góry nogami i szybko odwiruj, aby zagęścić płyn na dnie probówki.
3. PCR ampżyciecation (Informacje na temat ustawień operacyjnych można znaleźć w instrukcji przyrządu.)
3. 1 Umieść 8-probówkę do PCR w komorze próbki fluorescencyjnego urządzenia do PCR i ustaw próbkę do badania, kontrolę dodatnią i kontrolę ujemną, zgodnie z kolejnością ładowania.
3.2 Kanał detekcji fluorescencji:
(1) Gen ORF1ab wybiera kanał detekcji FAM (Reporter: FAM, Quencher: Brak).
(2) Gen N wybiera kanał detekcji VIC (Reporter: VIC, Quencher: Brak).
(3) Gen wewnętrznego standardu wybiera kanał detekcji CY5 (Reporter: CY5, Quencher: Brak).
(4) Wartość zadana pasywna jest ustawiona na ROX.
3.3 Ustawianie parametrów programu PCR:
Krok | Temperatura (℃) | Czas | Liczba cykli | |
1 | Reakcja odwrotnej transkrypcji | 50 | 15 minut | 1 |
2 | Aktywacja enzymu Taq | 95 | 2,5 minuty | 1 |
3 | Aktywacja enzymu Taq | 93 | 10 s | 43 |
Wydłużanie wyżarzania i pozyskiwanie fluorescencji | 55 | 30 s |
Po ustawieniu zapisz plik i uruchom program reakcji.
4.Results analysis
Po zakończeniu programu wyniki są automatycznie zapisywane i analizowana jest krzywa wzmocnienia. Krzywa wzmocnienia jest ustawiona na domyślny próg przyrządu.
【Explanation of test resuTo 】
1. Określ ważność eksperymentu: Kontrola dodatnia FAM, kanał VIC powinna mieć typową krzywą amplifikacji, a wartość Ct jest na ogół mniejsza niż 34, ale może się wahać ze względu na różne ustawienia progów różnych instrumentów. Kontrola ujemna FAM, kanał VIC nie powinna mieć wzmocnionego Ct. Ustalono, że powyższe wymagania muszą być spełnione jednocześnie, w przeciwnym razie badanie to będzie nieważne.
2. Ocena wyniku
Kanał FAM/VIC | Wynik wyroku |
Ct<37 | Test próbki jest pozytywny |
37≤Ct<40 | Krzywa amplifikacji ma kształt litery S i podejrzane próbki wymagają ponownego zbadania; jeżeli wyniki ponownego badania są spójne, ocenia się je jako pozytywne, w przeciwnym razie – negatywne |
Ct≥40 lub brak wzmocnienia | Test próbki jest negatywny (lub poniżej dolnej granicy wykrywalności zestawu) |
Uwaga: (1) Jeżeli zarówno kanał FAM, jak i kanał VIC są jednocześnie dodatnie, SARS-Cov-2 zostaje uznany za dodatni.
(2) Jeżeli kanał FAM lub kanał VIC jest dodatni, a drugi kanał jest ujemny, test należy powtórzyć. Jeśli jednocześnie wynik będzie pozytywny, zostanie uznany za pozytywny pod względem SARS-Cov-2, w przeciwnym razie zostanie oceniony jako negatywny pod względem SARS-Cov-2.